感染症の中でも、特に細菌や真菌（カビ）が原因菌となる場合の検査を行っております。病原細菌を培地に接種して一昼夜培養し、同定検査（菌名を決定する）、薬剤感受性検査（どの抗生物質が効果があるかを判定する）等を実施します。また、抗原抗体反応を利用したインフルエンザウイルス、アデノウイルス等のウイルス検査も実施しております。検査は主として認定臨床微生物検査技師が担当しています。また、病院感染対策を行っていくうえで細菌検査のデータは非常に重要なものであるため、感染制御認定臨床微生物検査技師が感染制御部と連携して活動を行っています。